二級公益事業單位與差額撥款事業單位并不完全對應。二級公益機構主要是資源，可以在一定程度上由市場配置，如高等教育、非營利性醫院、學校等。收入相對較少，但資源可以在一定程度上由市場配置，其功能和作用值得繼續發揮的單位被定義為全額撥款的二級公益機構。例如，水庫灌溉中心是典型的公益二級全額事業單位。對于收入相對較高的事業單位，這也是最常見的二級公益事業單位，其資金來源是差額撥款，最典型的是各地的醫院。
判斷公益性和撥款類別的最好方法是在公共機構公開招聘考試的年度職位表中看到詳細信息。
沒有辦法單純從公益一、二類來判斷員工的工資待遇。工資在很大程度上取決于其撥款方式。具體來說，在全額撥款的事業單位中，無論是公益還是公益，其人員資金都來自財政，工資來源更有保障。基本工資為國家標準，但績效工資總審批處于平均水平。大部分是根據工資改革前崗位對應的標準補貼來審批績效工資總額，很多單位也按照這個標準發放。在差額撥款的事業單位中，其基本工資也是按照國家標準發放的，但績效工資是根據單位收入確定的。如果是在收入穩定可觀的單位，比如醫院，工資水平遠高于全額撥款人員。然而，如果在收入來源不穩定的差額分配單位，其工資（主要是績效工資）的待遇水平可能會受到很大影響，如培訓中心、特殊幼兒園單位，這些單位人員績效工資收入波動很大，近年來下降非常明顯。
因此，準備進入公共機構的同志，如果非常關心工資，在選擇單位時，必須詳細了解其撥款類型，因為公共機構實施績效總量控制。全額撥款公共機構的工資收入基本上沒有波動，但整體工資收入水平較低。差額撥款公共機構應分為兩種類型。最好選擇收入能力和資金來源較強的單位。
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